Стратегической целью Счетной палаты является расширение возможностей достижения национальных целей за счет совершенствования системы государственного аудита в Российской Федерации.
Счетная палата проводит мониторинг достижения национальных целей и реализации нацпроектов в соответствии с законом о Счетной палате и поручениями президента. Для этого Счетная палата проводит специальные проверки и аналитические мероприятия, направляет в адрес федеральных органов исполнительной власти, парламента и Президента Российской Федерации свои рекомендации, публично обсуждает ход реализации нацпроектов и деятельности, направленной на достижение наццелей.