Росалкогольрегулирование недостаточно эффективно выполняет функции по контролю за производством и оборотом алкогольной продукции, в том числе не контролирует исполнение Росспиртпромом обязательств по контрактам. В результате Общество нарушает сроки выполнения заявок о приеме на хранение изъятой алкогольной продукции и оборудования, не соблюдает требования об обеспечении их сохранности. Счетная палата также отметила правовую неурегулированность отдельных вопросов. Так, уничтожение конфискованной алкогольной продукции может производиться только по решению суда. При этом сама Служба и ее территориальные органы полномочиями по обращению в суд не наделены. Кроме того, отсутствует порядок учета передаваемой на уничтожение алкогольной продукции.