В отчете аудитора Валерия Богомолова представлены результаты контрольного мероприятия «Проверка отдельных вопросов финансово-хозяйственной деятельности пригородных пассажирских компаний в части организации перевозок пассажиров железнодорожным транспортом общего пользования в пригородном сообщении в 2015-2016 годах и истекшем периоде 2017 года» (совместно с Контрольно-счетной палатой Ростовской области и Контрольно-счетной палатой Ярославской области). В отчете отмечается, что, несмотря на уменьшение в 2016 г. (по сравнению с 2014 г.) количества убыточных пригородных пассажирских компаний с 13 до четырех, деятельность большинства из них можно признать экономически неэффективной. Так, в 2016 г. чистая прибыль 12 компаний направлялась на погашение убытков прошлых лет и не способствовала их развитию, убытки до налогообложения по результатам деятельности от перевозок пассажиров сложились в 21 компании, кредиторская задолженность перед ОАО «РЖД» - у всех компаний, дебиторская задолженность по средствам региональных бюджетов - у 24 компаний. Минтрансом России, Росжелдором и регионами не обеспечено взаимодействие в части обеспечения эффективного исполнения полномочий регионов по организации транспортного обслуживания в пригородном железнодорожном сообщении, планирования объемов бюджетных ассигнований федерального и региональных бюджетов, а также установления экономически обоснованного уровня тарифов. Проверка также показала, что, несмотря на значительную государственную поддержку крупных инфраструктурных проектов, реализуемых РЖД, объем инвестиций, направляемый на развитие инфраструктуры пригородного комплекса, незначителен. Так, в 2018 г. он предусмотрен в размере 3,4 млрд руб. (0,6% от общего объема инвестиционной программы). Аналогичные суммы предусмотрены на 2019 и 2020 гг.