Поступления от платы за пользование водными объектами, находящимися в федеральной собственности, составляют 96% от общей суммы прогнозируемых доходов, администрируемых Росводресурсами. В 2015 и 2016 годах отклонение от прогнозного показателя составило 0,9% и 8,3%, соответственно. Проверка выявила пробелы нормативно-правового регулирования в сфере водных отношений, оказывающие отрицательное влияние на эффективность взимания платы за пользование водными объектами. Так, законодательством не предусмотрен порядок перерасчета платы в случае увеличения фактического объема забора воды над объемом, указанном в договоре водопользования. В результате плата за превышение объема забора воды не начисляется и в бюджет не поступает.